El Consejo Nacional del Frente Democrático Nacional de Filipinas denunció el 21 de julio al gobierno de Duterte por su designación del NDFP como "organización terrorista", diciendo que esto señala la escalada del terrorismo de Estado contra el NDFP y sus 18 organizaciones aliadas. Dijo que la etiqueta "terrorista" también verá una "escalada de ataques contra los activistas sociales legales, los defensores de los derechos humanos, los críticos y los opositores" que serán etiquetados arbitrariamente como miembros y asociados del NDFP.
El NDFP afirmó: "Somos una fuerza cobeligerante en la guerra civil con el Gobierno de la República de Filipinas, y tenemos el estatus de beligerancia de acuerdo con el derecho internacional... Es completamente mendaz y malicioso calificar al NDFP como una organización 'terrorista'".
El consultor político jefe del NDFP, el profesor José María Sison, añadió que "la designación está en guerra con los principios básicos del derecho internacional humanitario sobre el estatus, los derechos y el carácter legítimos de los movimientos de liberación nacional". Dijo que la designación de "terrorista" tiene la clara intención de "acosar, silenciar, detener o incluso matar a los consultores del NDFP y a las personas que participan en las negociaciones de paz entre el GRP y el NDFP, e incluso a los defensores de la paz, los críticos y los opositores".
El profesor Sison advirtió que Duterte pretende amañar las elecciones de 2022 para mantenerse en el poder y evitar su detención por la Corte Penal Internacional por crímenes contra la humanidad.
El Consejo Antiterrorista del gobierno de Duterte firmó una resolución el 23 de junio de 2021 en la que declaraba al NDFP como "organización terrorista". El ATC hizo pública la resolución el 19 de julio. La resolución afirmaba que "el NDF es el núcleo y el grupo más consolidado que proporciona apoyo a la expansión armada y organizativa del Partido Comunista de Filipinas / Nuevo Ejército del Pueblo".
El Consejo contra el Blanqueo de Capitales anunció poco después que comenzaría a congelar las cuentas financieras relacionadas con el NDFP.
La Sra. Julieta de Lima, presidenta interina del Panel de Negociación del NDFP, calificó la designación como un "clavo innecesario en el ataúd de las negociaciones de paz entre el GRP y el NDFP". Calificó la designación como un acto anti-paz y dijo que "es un gran desperdicio que Duterte tire por la borda todo lo que se ha logrado en las prolongadas y arduas negociaciones de paz". Señaló los logros de ambas partes en las partes más importantes del Acuerdo General sobre Reformas Sociales y Económicas.
La versión del NDFP del CASER, subrayó, "es una prueba clara y brillante contra las acusaciones de los verdaderos terroristas, Duterte y los suyos".
A pesar de la etiqueta de "terrorista", el Consejo Nacional del NDFP dijo que mantendrá su panel de paz, "con la esperanza de que el régimen de Duterte sea finalmente expulsado del poder y que una administración posterior a Duterte esté dispuesta a reanudar las negociaciones de paz para una paz justa y duradera".